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使用NTAIDA填料純化蛋白的常見問題解析

更新時間:2021-05-11 點擊次數:2625

Ni Tanrose 6FF(NTA)親(qin) 和介質是將金屬離子Ni2+螯合在以氨三乙酸(NTA)為(wei) 配基的瓊脂糖凝膠上形成的親(qin) 和層析介質,較 IDA 結合Ni2+牢固一些。具有吸附量大、選擇好、易於(yu) 再生、成本低等特點,廣泛用於(yu) 生物製藥和生物工程下遊蛋白質和多肽的分離純化,尤其是組氨酸標簽蛋白質的高效純化。

 

Ni Tanrose 6FF(IDA)親(qin) 和介質是將金屬離子Ni2+螯合在以亞(ya) 氨基二乙酸(IDA)為(wei) 配基的瓊脂糖凝膠上形成的親(qin) 和層析介質,是一種非常悠久的Ni2+親(qin) 和填料,由於(yu) Ni2+與(yu) 配基鼇合鍵較少,容易受到小分子的攻擊而使Ni2+容易脫落,但其載量也相對較高。


以下是使用NTA/IDA填料可能會(hui) 出現的問題及解決(jue) 方法:

 

01 通過His標簽純化的蛋白,雜質比較多應當怎麽(me) 做?

 

①可能原因:蛋白酶會(hui) 降解部分目的蛋白。

解決(jue) 方法:加入多種蛋白酶抑製劑改進。

②可能原因:雜質蛋白與(yu) 鎳柱親(qin) 和力強。

解決(jue) 方法:可提高雜質蛋白與(yu) 鎳柱結合起始咪唑濃度。

③可能原因:雜蛋白和目的蛋白結合。

解決(jue) 方法:可通過超聲前加入去垢劑或者還原劑消除(1%-2% Triton X-100)。

④可能原因:洗滌不充分。

解決(jue) 方法:增加洗滌的次數,充分洗滌。

 

02 標簽蛋白不與(yu) 金屬螯合親(qin) 和層析柱結合應當怎麽(me) 做?

 

①可能原因:超聲的功率不對(功率太大會(hui) 導致蛋白炭化,功率太小會(hui) 導致蛋白沒有釋放)。

解決(jue) 方法:改變超聲功率或超聲前嚐試添加溶菌酶增加細胞破碎率。

②可能原因:組氨酸標簽暴露不完Q。

解決(jue) 方法:在變性條件下(4-8M脲或4-6M鹽酸胍)進行純化,此時Ni-6FF(IDA)中鎳離子容易脫落,可選擇耐受變性劑的螯合填料,如月旭科技的親(qin) 和填料Ni Tanrose 6FF(NTA)。

③可能原因:His標簽丟(diu) 失。

解決(jue) 方法:WB檢查His-tag是否表達,上遊構建,改變His-tag的位置(C-端或N-端),必要時增加標簽個(ge) 數;孵育的時間不夠,降低流速和增加孵育的時間。

 

03 用幾次後鎳柱載量下降、掛柱效率低,應該怎麽(me) 做?

 

可能原因:

逐漸積累沉澱,變性或非特異結合的蛋白占據了有效的結合位點,並且通過洗脫液無法*清洗所致。

 

解決(jue) 方法:

較溫和的清洗方式:用2倍柱體(ti) 積的6M鹽酸胍或8M尿素洗滌,然後用5倍體(ti) 積的緩衝(chong) 液洗滌,以去除沉澱或變性物質,接著用2倍柱體(ti) 積的1% Triton X-100洗滌,然後用5倍柱體(ti) 積的緩衝(chong) 液洗滌,以去除疏水結合的物質。若改變不明顯,可選擇強烈清洗方式。

強烈清洗方式:首先用5-10倍柱體(ti) 積的脫鎳緩衝(chong) 液(20 mM 磷酸鈉,0.5 M NaCl,,50 mM EDTA,pH 7.4)洗滌,進行脫鎳操作,然後用5-10倍柱體(ti) 積的平衡緩衝(chong) 液衝(chong) 洗,最後用5-10倍柱體(ti) 積的雙蒸水衝(chong) 洗;隨後進行清洗操作,去除離子型雜蛋白,可以用5倍柱體(ti) 積的1.5M NaCl溶液,然後10倍柱體(ti) 積的雙蒸水衝(chong) 洗;去除沉澱或變性蛋白,可以用1M氫氧化鈉溶液,結合1-2小時,然後用10倍柱體(ti) 積的平衡緩衝(chong) 液和10倍柱體(ti) 積的雙蒸水迚行衝(chong) 洗;去除疏水蛋白或者脂蛋白,可以用5-10倍柱體(ti) 積的30%異丙醇溶液清洗,然後10倍柱體(ti) 積的雙蒸水洗滌;最後進行生鎳操作,用0.1M硫酸鎳上柱,隨後5倍柱體(ti) 積的雙蒸水和平衡緩衝(chong) 液迚行洗滌。如需保存,保存在20%乙醇溶液。

 

04 簽蛋白結合在填料上洗脫不下來,應該怎麽(me) 做?

 

①可能原因:洗脫條件太溫和(標簽蛋白仍然結合在柱上,結合力較強)。

解決(jue) 方法:增加咪唑的梯度洗脫或降低pH 來找出最佳的洗脫條件。

②可能原因:降低pH的方法洗脫,若pH低於(yu) 3.5,會(hui) 導致鎳離子脫落。

解決(jue) 方法:改變洗脫辦法,如咪唑競爭(zheng) 性洗脫。

③可能原因:蛋白已沉澱在柱上。

解決(jue) 方法:1.減少上樣量,或使用咪唑的線性梯度而不是分步洗脫以降低蛋白的濃度。試用去汙劑或改變NaCl的濃度,或在變性條件(去折疊)下洗脫(用4-8 M脲,或4-6 M鹽酸胍);2.蛋白在柱上變性固化,用0.5M氫氧化鈉洗柱。

④可能原因:非特異性疏水或其他相互作用。

解決(jue) 方法:加非離子去汙劑到洗脫緩衝(chong) 液(如:2% Triton X-100)或增加NaCl的濃度。

⑤可能原因:在填料表麵形成高密度融合蛋白的聚集。

解決(jue) 方法:選擇合適載量的填料,切勿一味追求高載量。

 

05 柱使用過程中發現堵塞嚴(yan) 重,且流速越來越慢應該怎麽(me) 做?

 

可能原因:

樣品中細胞碎片或其他雜顆粒所致。

 

解決(jue) 方法:

樣品處理過程中,高速離心,推薦用0.45um的濾膜過濾。如果柱子堵塞嚴(yan) 重,重生時使用1% Triton X-100/PBS浸泡過夜。流速慢,可在柱子下麵接一根軟管。

 

06 鎳柱使用過程中出現棕色應該怎麽(me) 做?

 

可能原因:

緩衝(chong) 液中DTT的影響,DTT會(hui) 對鎳柱的顏色和純化效率有很大的影響,在堿性的緩衝(chong) 液條件下,鎳離子會(hui) 被DTT還原生成棕色的沉澱,所以要盡量避免DTT的參與(yu) 。

 

解決(jue) 方法:

若樣品中含有DTT,在上樣之前, 我們(men) 推薦采用不含還原性試劑的空白運行來除去任何較弱結合的鎳離子。

空白運行方法(使用不含還原劑的平衡液和洗脫液):

1)5倍柱體(ti) 積的雙蒸水洗柱;

2)5倍柱體(ti) 積的平衡液洗柱;

3)5倍柱體(ti) 積的洗脫液洗柱;

4)10倍柱體(ti) 積的平衡液平衡。

當不使用時,勿將Ni Tanrose 6FF(IDA)保存於(yu) 含還原性試劑的緩衝(chong) 液中。

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